課程資訊
課程名稱
生物技術核心實驗
Biotechnology Core Techniques 
開課學期
103-2 
授課對象
系統生物與生物資訊學程  
授課教師
林乃君 
課號
Prog5074 
課程識別碼
P05 U2020 
班次
02 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四2,3,4,@,5,6,7,8(9:10~16:20) 
上課地點
 
備註
初選不開放。教室:生科館3C。需於1/19~1/22至生技中心報名,需繳學分費。週四第@節請勿排他課。與楊啟伸、陳俊任合開
總人數上限:40人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1032Prog5074_02 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
本課程尚未建立核心能力關連
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

生物技術核心實驗課程
(一)、課程大綱:
本課程為生物技術學程之重要基礎實驗科目,整個流程以分子生物中心法則(Central Dogma)為骨幹,學習由GUS酵素基因之DNA開始,經過剪接與基因轉殖,從宿主細胞中表現並檢定其mRNA,然後收集純化並檢定目標酵素。本課程由基本的自動吸管開始,教導基礎的核酸及蛋白質操作技術,對出入生物技術領域的初學者有很大的幫助。
1. DNA manipulation
(1). Basic Techniques
a. Pipetting
b. Spectrometry
c. Bacterial culture techniques
(2). DNA preparation
a. Miniprep of plasmid DNA
b. Restriction analysis
c. Large scale digestion of plasmid
(3). DNA ligation
a. Isolation of DNA fragment
b. Quantification analysis of DNA
c. DNA ligation
(4). Transformation
a. Transformation by CaCl2
(5). Protein expression system
a. Colony hybridization
b. Histochemical detection
(6). Detection of specific nucleic acid sequences by hybridization
a. mini-prep of plasmid DNA
b. Restriction analysis
c. Southern boltting

2. RNA hybridization
(1). RNA Preparation
a. Total RNA isolation
b. In vitro transcription
(2). DIG-labeled probe preparation
a. Random priming
b. PCR reaction
(3). Northern blot hybridization
a. RNA analysis
b. Northern blotting
c. Northern blot hybridization
d. Detection of probe by enzyme immunoassay
e. Analysis of the blot

3. Protein analysis
(1). Protein purification
a. Protein extraction
b. Gel filtration
(2). Ion exchange chromatography
a. Ion exchange chromatography
b. Activity assay
(3). Affinity chromatography
a. Affinity chromatography
b. Activity assay
(4). Electrophoresis analysis
a. SDS-PAGE
b. Protein transfer
c. Immunostaining

(二)、成績評量:
本課程共分成DNA、RNA、蛋白質三大部份,分別由三位教師分別授課。
成績計算方式為;依照各部份小考、段考以及報告成績計算出各段成績,再以三段成績及平時操作表現計算出總成績。 

課程目標
 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
出席情況 
10% 
缺席一堂課扣0.7分 
2. 
實驗 
20% 
預報(20%) 實驗表現(40%) 實驗考試(40%) 
3. 
Protein 
20% 
小考(20%) 平時(30%) 實驗結報(50%) 
4. 
RNA 
20% 
小考(40%) 實驗結報 (60%) 
5. 
DNA 
30% 
小考(15%) 段考(25%) 實驗結報 (60%) 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
  【DNA0】Introduction 
第2週
03/05  【DNA1】
1. Introduction
2. Cloning tools
 
第3週
03/12  【DNA2】
Cloning strategies (I):
Preparation of DNA 
第4週
03/19  【DNA3】
Cloning strategies (II):
Restriction analysis and ligation 
第5週
3/26  【DNA4】
Cloning strategies (III):
Transformation and identification
of transformants 
第6週
4/2  溫書假 
第7週
4/9  【DNA5】
Alternative cloning strategies 
第8週
04/16  【DNA6】
Protein expression systems 
第9週
4/23  【RNA1】
1. RNA in general
2. RNA preparation 
第10週
4/30  【RNA2】
Denaturing gel electrophoresis 
第11週
  【RNA3】
1.Probe preparation
2. Northern hybridization analysis 
第12週
  【RNA4】
Analysis of RNA by primer extension, S1 analysis, RNase protection and nuclear run-off 
第13週
  【Protein1】
1.Protein in general
2.Protein extraction
3.Gel filtration chromatography 
第14週
  【Protein2】
1. Ion exchange chromatography
2. Affinity chromatography 
第15週
  【Protein3】
1. Protein assay
2. Polyacrylamide electrophoresis
3. Protein transfer 
第16週
  【Protein4】
Immunological tools 
第17週
  實驗期末考